药学部位于住院部综合楼六楼，设有门诊药房、中药房、五官科药房、住院药房、药库、临床药学室、药学教研室、分析室、制剂室、药物临床试验机构等。

科室拥有Waters 1525 高效液相色谱仪一台；RCZ-8A智能药物溶出仪一台；SHIMADZU紫外分光光度计一台；液体灌装机一台；乳化搅拌机一台；万级净化车间；局部百级层流净化车间、全自动封口机一台；粉体分装机一台。

科室长期保证全院药品的供应；制剂室负责医院自配制剂的生产；临床药学室负责国家临床药师培训、抗菌药物的监测、不良反应的上报、处方点评、药物专项点评和合理用药监控等；药品分析室负责全院药品质量。最新开展的项目有与临床科室共同合作药物临床试验研究。

科室现有药师40名，其中高级职称3人，中级职称15人，初级职称20人。